怎么分辩猫的品种?
这个问题,让我回想起了当年学习生物的时候区分不同物种的方法。。。 猫是一种身材紧凑、四肢短小、头圆而耳大的哺乳动物。(这点和狗很相似)
根据外型特征,可以将猫划分成4个亚种:
1. 家猫(Feral Cat)
2. 非洲野猫(African Wildcat)
3. 欧洲野猫(European Wildcat)
4. 亚洲野猫(Asian Wildcat 或 印度野猫)
当然,这些亚种的分类也不是绝对化的,例如野生美洲猫就兼具了亚洲野猫与欧洲野猫的特征;而在欧洲,由于野兔的数量被有效控制,因此野生欧洲猫也具有了明显的家猫特征。 要判断一个物种到底是什么亚种,最好的方法还是看基因组序列,最可靠的方法是检测单核苷酸多态性(SNPs)。不过对于非专业人士来说,目前有一个更方便的方法,那就是使用NCBI的GeneCards Server,只需要输入基因的编号就可以查询该基因在不同物种中的信息,包括功能域、氨基酸序列及基因家族成员等信息 点击左侧物种过滤器,可以选择要查看的物种范围,然后就可以看到结果啦! Gene Cards提供了不同物种间5986个基因的差异,通过它们来鉴定不同物种的关系应该是没问题的吧~ 比如我们最熟悉的猫科动物虎和狮,通过基因序列对比后发现,两者的差异为710个多态性位点,从而可以推断出它们之间的亲缘关系。 当然,Gene Cards只是提供了一个工具,结果还是需要大家自己来分析哦~ 除了利用物种内已发现的遗传变异来判定物种之间的关系,还有一种方法叫做“群体遗传分析”(Population Genetic Analysis)。这种方法可以通过比较基因组间的单倍型(Haplotype)或者是基因的多态性比率(Polymorphism Frequency)来评估物种之间同源关系的远近。 因为单倍型是某个基因在所有染色体上拷贝数的总和,因此能提供该基因在物种进化过程中是否受损的信息。而基因的多态性比率则是同一基因在不同物种内的变异程度,所以能提供物种进化速率的信息。 根据物种间单倍型或者基因多态性比率的相似程度,可以将物种分成以下五个等级: 以上两种方法都需要大量的基因组数据才能得出较准确的结论,那么对于只有少量基因组的物种应该如何处理呢?不用担心,还有方法! 如果你手头上有一堆大小不同、形状各异的坚果,不知道它们是同一种类吗?没关系,把坚果放在水里,让它漂浮起来就好了!同理,如果手头上的样本少得只能一个一个地分析了,那也好办!用聚类分析的方法把它们聚到一起就好啦!